Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mesp1P97309 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Mesp1P97309 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Mesp1P97309 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
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Mesp1P97309 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms