Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rps29P62274 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rps29P62274 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms