Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ufm1P61961 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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