Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrnp3P59055 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrnp3P59055 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms