Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Irf5P56477 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf5P56477 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
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