Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrp1P56183 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms