Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rad23aP54726 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms