Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2e3P52483 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms