Protein–RNA interactions for Protein: P52019

Sqle, Squalene monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SqleP52019 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SqleP52019 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SqleP52019 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SqleP52019 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SqleP52019 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SqleP52019 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SqleP52019 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SqleP52019 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms