Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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VdrP48281 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VdrP48281 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VdrP48281 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VdrP48281 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VdrP48281 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VdrP48281 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
VdrP48281 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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