Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkn1bP46414 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms