Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Rpl28P41105 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Rpl28P41105 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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