Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnar1P33896 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnar1P33896 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms