Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctnnd1P30999 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctnnd1P30999 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms