Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrkcdP28867 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms