Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PdgfraP26618 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PdgfraP26618 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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