Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TP20293 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TP20293 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TP20293 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TP20293 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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