Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PdgfaP20033 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms