Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

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Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NefhP19246 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NefhP19246 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NefhP19246 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NefhP19246 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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