Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tnnc1P19123 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms