Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CtsdP18242 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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