Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nr4a1P12813 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms