Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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