Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Copb2O55029 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms