Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Per1O35973 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Per1O35973 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Per1O35973 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Per1O35973 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Per1O35973 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Per1O35973 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Per1O35973 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Per1O35973 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Per1O35973 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Per1O35973 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Per1O35973 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Per1O35973 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Per1O35973 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Per1O35973 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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