Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms