Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
MttpO08601 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MttpO08601 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms