Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp35M0QWN7 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms