Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Gm21060J3KMU4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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