Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sclt1G5E861 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sclt1G5E861 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms