Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC6.27□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Gm20538F6Z9R1 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Il17f-201ENSMUST00000039046 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Plec-209ENSMUST00000089610 14972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Frrs1-201ENSMUST00000040260 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms