Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
E130114P18RikF6S0S7 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms