Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm340F6RGI3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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