Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brd1E9PZ26 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms