Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms