Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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