Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Phf11cB4XVP9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Phf11cB4XVP9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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