Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Clrn2B2RVW2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms