Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp42B2RQC2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp42B2RQC2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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