Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Brpf3B2KF05 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brpf3B2KF05 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms