Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Tmem238A9JSM3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms