Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al1jA2BFR3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms