Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pramel3A2AHA7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pramel3A2AHA7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms