Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mbd3Q9Z2D8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mbd3Q9Z2D8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms