Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
VarsQ9Z1Q9 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms