Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL7

Abt1, Activator of basal transcription 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abt1Q9QYL7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Abt1Q9QYL7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms