Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
SrfQ9JM73 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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SrfQ9JM73 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SrfQ9JM73 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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