Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prg3Q9JL95 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms