Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ldb3Q9JKS4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms