Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DysfQ9ESD7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
DysfQ9ESD7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms